在885年三月，唐僖宗一众从成都回到了久违的长安。这时的长安遭大乱后荆棘满城，狐兔纵横，一副触目荒凉的景象，唐僖宗心下甚为不乐。想起在蜀地虽然时常担心黄巢会夺取天下，但蜀地的山川秀丽、锦绣繁华使他得以暂忘一切烦恼，日日深杯酒满，夜夜笙歌不断，倒也乐得个逍遥自在。

听说又有秦宗权称帝，更增郁闷，便下诏令徐州节度使（治所在徐州，辖泗州、宿州、濠州共四州）时溥为蔡州四面行营兵马都统以讨宗权。黄巢虽平，秦宗权势力犹炽。当黄巢陈州之败时，秦宗权见情况不妙便保全有生力量从黄巢手中脱走回到蔡州，养兵练卒，势力陡增。他开始分兵寇掠邻道，这秦宗权之残暴又远甚于黄巢，大军出行粮运未到，竟然用车载着用盐腌的尸体作为军粮。秦宗权令其将陈彦侵淮南，秦贤侵江南，秦诰陷襄州、唐州、邓州，孙儒陷东都、孟州、陕州，张晊陷汝州、郑州，卢瑭攻汴州、宋州，所至屠翦焚荡，成为一片废墟。州、镇幸存者仅能保守一城，极目千里，无丝毫烟火气。攻陷东都后秦宗权自以为所向无敌，不可一世。　心说道“李家无能，这皇帝黄巢做得，我做不得吗？”于是他便叛唐自称皇帝，设置百官。

由于当时藩镇各专租税，不供朝廷。朝廷度支仅靠京城、同州、华州、凤翔等数州租税。在僖宗幸蜀后，田令孜在蜀又募新军五十四都，每都千人，南牙、北司官员也有万馀人。而为使唐僖宗整日沉醉于声色犬马而荒废政事，田令孜每日以奢靡的宴饮与声伎、优伶来供奉他。因此田粮不够赡军，赏赐也难以按时发放，诸士卒都有怨言。田令孜很是担心日久会有变故。这时他忽然想到了安邑、解县这两个地方，盛产食盐，有盐池之利，贩卖之利本来属于朝廷。可在黄巢之乱时，河中节度使王重荣因作战耗费甚巨，便独占了盐池之利。但王重荣仍然每年都向朝廷奉献三千车以供国用。

田令孜想把盐田之利全部抢回，便向唐僖宗上奏恢复旧制。于是田令孜便兼任两池榷盐使，夺了盐池，收其利以赡军。王重荣极其愤怒，向皇帝上章论诉不已，“臣当初占据盐池也是权宜之计，实因与黄巢作战军用不足。然岁奉朝廷足显臣之忠心。田令孜如今将此盐池强行抢去，臣之数万将士衣食不足，实在让人心寒。恳请陛下收回成命，臣愿岁奉五千车以供国用。”唐僖宗终是难违田令孜之意愿，屡次遣中使去安慰王重荣，希望他能宽宏大量，不以此事为意。王重荣愤郁难平。

数日后发生的一件事，让王重荣再难遏制心中的盛怒。 当时田令孜专权，唐僖宗之旨意全由己出。他自以为用唐僖宗的名义来发布号令，天下莫敢不从。对跋扈之藩镇不敢如何，但却多遣亲信视察那些尊奉朝廷的节度使，有不附己者，便想方设法除掉。田令孜令养子田匡祐出使河中，王重荣待之甚厚，而匡祐却傲慢无礼，举军皆愤怒。王重荣也是愤怒已极，便令军士数其罪恶，责其无礼，欲动用笞刑。监军好说歹说才使得田匡祐免了一顿鞭子，在一片唾骂声中脱归。回去后，他告诉田令孜此事，田令孜便决定除去王重荣的河中节度使之位。他令唐僖宗下诏，徙王重荣为泰宁节度使，让王处存来做河中节度使，以原泰宁节度使齐克让去做义武节度使。还下诏令李克用以河东军护送王处存赴镇。

王重荣得旨后大怒，对将佐们说道“收复京城我亦有大功。天子岂能不知？真可惜其为奸宦所掌控。吾之一片丹心，却为阉竖所隔，不能上达帝所！奸贼欲将我远逐，我岂能再忍？今番我要带诸军清君侧之恶，以正皇帝之尊！”于是王重荣令人向唐僖宗上表，论田令孜离间君臣，数田令孜十罪。王处存不愿改往他镇，也向皇帝上言："幽、镇攻臣之兵新退，臣暂未敢离治所。况且王重荣无罪，且有大功于国，不宜轻易改镇，以动摇诸藩镇之心。"

田令孜看王重荣要“反”，便联结邠宁节充使朱玫、凤翔节度使李昌符对抗王重荣。王重荣求救于李克用，李克用亦知田令孜奸邪，黄巢攻入京师，天子播迁，多半都是为此阉所误，于是李克用欣然愿往。而朱玫、李昌符亦阴附于朱全忠，更让李克用怒气难平。李克用向皇帝上言："朱玫、李昌符与全忠相表里，欲共灭臣，臣不得不自救，现已集蕃、汉兵十五万，准备来年济河，自渭水以北讨伐二镇；绝不靠近京城，臣敢保无掠扰之患，圣驾无虞，请天子放心。诛二镇后，臣当旋师灭全忠以雪仇耻。"皇帝派使者和解李克用与朱玫、李昌符，然而往返数十次，丝毫不起作用。而朱玫想要朝廷一并讨伐李克用，便使了奸计。他多次派人暗入京城，放火烧粮，刺杀皇帝贴身侍者，嫁祸给李克用。于时京师震恐，皇帝心惊。

十一月，田令孜遣朱玫、李昌符两镇军及神策军，鄜、延、灵、夏等州军各三万人屯兵沙苑。王重荣发兵相拒，并告急于李克用，克用引兵急赴。王重荣与朱玫等相守月余，李克用兵终于到达，先向皇帝上表请诛田令孜及朱玫、李昌符。唐僖宗下诏和解，两方均不听。于是十二月下旬两军合战，朱玫、李昌符被李克用、王重荣杀得大败，各自逃回本镇，溃军所过焚烧抢掠、无恶不作。李克用、王重荣向京城进军，志要除掉田令孜。田令孜吓得连夜带天子自开远门出走，逃往凤翔。若再追的话，怕会惹上逼天子之嫌，李克用与王重荣便各自回军了。之后他们继续向皇帝上表，列数田令孜之罪，希望天子将其诛杀。